数学科学学院的前身是1952年创建的江苏教育学院数学科，1980年更名为数学系，1999年更名为数学与计算机科学系，2004年拆分成数学系和信息技术系，2010年合并成立数学与信息技术学院，2022年拆分整合成立数学科学学院。

学院现有数学与应用数学、应用统计学两个本科专业，其中数学与应用数学专业与学校同龄，是学校创办最早的专业之一。1959年开始招收数学与应用数学专业普通本科生；2017年开始招收应用统计学专业普通本科生；2021年开始招收数学与应用数学乡村教师定向师范生。

数学与应用数学专业为省级成人特色专业建设点(2011)、校级重点专业(2016)、江苏省一流专业建设点(2020)、校级课程思政示范专业(2021)、江苏省特色专业建设点(2021)。2022年数学与应用数学专业获批国家级一流专业建设点，2024年获批江苏普通本科高校课程思政典型案例（专业）。

2016年开始与南京师范大学联合培养学科教学(数学)专业硕土研究生，2020年开始与贵州师范大学联合培养学科教学(数学)专业硕士研究生。2015年数学学科获批校级重点建设学科，2022年数学学科获批江苏省“十四五”省级重点建设学科。2024年10月数学与应用数学专业通过二级认证。2025年获批“数学智能与视觉计算”省高校重点（建设）实验室。

学院现已形成一支年龄、职称和学历结构较为合理、专业技术水平较高、科研能力较强的师资队伍。专任教师中，有教授11人、副教授9人，博士29人、硕士11人，研究生导师9人，江苏省“333高层次人才培养工程”培养对象2人，江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人培养对象2人，江苏省“青蓝工程”优秀青年骨干教师培养对象8人，江苏省“青蓝工程”优秀教学团队1个，江苏省科技副总6人。

近年来，教师主持国家自然科学基金项目9项、省部级项目5项、教育部产学合作协同育人项目8项以及市厅级等课题20多项，发表核心期刊以上论文100多篇，获国家级教学成果奖二等奖2项。出版专著、教材10余部，其中，有3位教师分别编写了3套国家级中学数学课标教材(2位主编，1位副主编)，5位教师参与国家课标教材编写和培训工作。教师获全国高校青年教师数据科学与商业分析案例教学竞赛一等奖1项、江苏省高校教师教学创新大赛二等奖1项、江苏省高校数学基础课青年教师授课竞赛一等奖2项、二三等奖12项。6人获校级“教学十佳”。

学院重视学生培养，人才培养成效显著:学院先后选派多批学生前往加拿大多伦多大学、美国布鲁菲尔德学院、台湾国立屏东大学等高校交流学习。近年来，学院有100余名学生先后考取了德国多特蒙德大学、澳大利亚昆士兰大学、香港科技大学、北京师范大学、华东师范大学等知名高校的硕士研究生，研究生考取率达20%；学生参加全国大学生数学建模竞赛、全国大学生数学竞赛、全国大学生市场调查与分析大赛等学科竞赛，获得国家和省级奖项200余项；立项省级大学生创新创业项目34项，其中10项为省级重点项目。毕业生就业率一直保持在98%以上 。